La recherche et l'évaluation de la recherche
Le service de l'archéologie mène la politique de détection et d'étude du patrimoine archéologique régional. 
Il dispose de deux modes de recherche : l'archéologie préventive et l'archéologie programmée.
L'ensemble de la recherche est soumis à une double évaluation scientifique, celle du service régional de l'archéologie et celle de la commission territoriale de la recherche archéologique (CIRA).https://www.culture.gouv.fr/Thematiques/archeologie/Acteurs-formations/Les-instances-scientifiques-de-l-archeologie/les-commissions-territoriales-de-la-recherche-archeologique
 

L'inventaire archéologique national
Le service  de l'archéologie met à jour l'inventaire archéologique national ou carte archéologique nationale qui rassemble toutes les données disponibles relatives au patrimoine archéologique : sites archéologiques connus, opérations réalisées, mesures de protection...
En constante évolution, la carte archéologique restitue un état de la connaissance sur un territoire donné. Elle est à la fois un instrument de recherche pour les archéologues et un outil de gestion du patrimoine archéologique.

La protection du patrimoine
Le service de l'archéologie assure le porter à connaissance des informations relatives au patrimoine archéologique. Il met en place les dispositifs de protection propres à l'archéologie et contribue à l'élaboration de protections gérées par les autres services de la DAC.
Le service  de l'archéologie assure la gestion des découvertes fortuites et est habilité à engager des poursuites pénales en cas de destruction de vestiges

La conservation du patrimoine
Le service  de l'archéologie est destinataire et responsable des données scientifiques et culturelles issue de la recherche : mobilier archéologique, documentation scientifique et rapports d'opérations.
Il contrôle le classement et le conditionnement de cette documentation. Il veille à la conservation, la restauration et la consultation de cette documentation et assure l'application du régime de propriété propre aux vestiges archéologiques.

La diffusion et la valorisation
Le service  d'archéologie accompagne la valorisation scientifique et culturelle du patrimoine archéologique. Il coordonne chaque année les Journées européennes de l' archéologie et assure la publication du Bilan scientifique régional. Il soutient les actions de diffusion de la recherche : publications, colloques, expositions.